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[慶賀]恭喜張清貿醫師升任北榮傳醫科主治醫師-20170201

作者 主題: biomaRt  (閱讀 77 次)

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biomaRt
« 於: 十月 04, 2018, 12:56:50 am »
Interface to BioMart databases (e.g. Ensembl, COSMIC, Wormbase and Gramene)

https://bioconductor.org/packages/release/bioc/html/biomaRt.html


程式碼: [Select]
library(biomaRt)
ensembl <- useMart("ensembl",dataset="hsapiens_gene_ensembl")
my.genes <- c("ENSG00000284190", "ENSG00000171658", "Something else")
out <- getBM(attributes=c("ensembl_gene_id", "gene_biotype"),
    filters="ensembl_gene_id", values=my.genes, mart=ensembl)
out <- out[match(my.genes, out$ensembl_gene_id),] # now in correct order/length.
https://support.bioconductor.org/p/104800/
« 最後編輯時間: 十月 04, 2018, 01:32:09 am 由 admin »
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