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[開學]105學年第2學期的課程看版開張了 歡迎同學問問題-20170201

作者 主題: Biopython  (閱讀 90 次)

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Biopython
« 於: 二月 07, 2017, 01:14:25 am »
Simple FASTA parsing example
程式碼: [Select]
from Bio import SeqIO
for seq_record in SeqIO.parse("ls_orchid.fasta", "fasta"):
    print(seq_record.id)
    print(repr(seq_record.seq))
    print(len(seq_record))

Simple GenBank parsing example
程式碼: [Select]
from Bio import SeqIO
for seq_record in SeqIO.parse("ls_orchid.gbk", "genbank"):
    print(seq_record.id)
    print(repr(seq_record.seq))
    print(len(seq_record))
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