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[開學]106學年第1學期的課程看版開張了 歡迎同學問問題-20170917

作者 主題: Tools on Linux  (閱讀 260 次)

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Tools on Linux
« 於: 四月 13, 2017, 02:53:20 am »
STAR:Spliced Transcripts Alignment to a Reference
https://github.com/alexdobin/STAR
BWA:Burrows-Wheeler Aligner
http://bio-bwa.sourceforge.net/

Samtools (內建套件和下載的參數不同)
http://samtools.sourceforge.net/
Bowtie2(內建套件和下載的參數不同)
http://bowtie-bio.sourceforge.net/bowtie2/index.shtml

FastQC(先裝Java)
https://www.bioinformatics.babraham.ac.uk/projects/download.html

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